Pruebas de detección del SARS-CoV-2 (COVID-19)
Antecedentes y transmisión
Según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de EE. UU., la COVID-19 es una enfermedad respiratoria que se puede transmitir de persona a persona. La principal vía de infección es entre personas que están en contacto cercano (a una distancia de aproximadamente 1,8 metros) a través de las gotitas respiratorias que se producen cuando una persona infectada tose o estornuda. También es posible que una persona contraiga la COVID-19 al tocar una superficie u objeto contaminado con el virus y luego tocarse la boca, la nariz o los ojos. Actualmente, no se cree que la transmisión a través de superficies sea la principal vía de propagación del virus; sin embargo, la actualización del 13 de abril de los CDC señaló: “La COVID-19 es una enfermedad nueva y todavía estamos aprendiendo cómo se propaga y la gravedad de la enfermedad que provoca.”
Contaminación de superficies
Estudios recientes sugieren que el virus SARS-CoV-2 puede permanecer viable e infeccioso en superficies durante horas o días, dependiendo del tipo de material de la superficie (tela, azulejo, acero, etc.). Los CDC recomiendan una limpieza y desinfección exhaustivas de las superficies que se tocan con frecuencia, considerándolas esenciales para prevenir la propagación de la infección¹. La presencia o ausencia del material genético viral en superficies ambientales ahora se puede comprobar directamente con la nueva prueba molecular de EMSL para el SARS-CoV-2 y utilizarse para demostrar la eficacia de los protocolos de limpieza. Los resultados de la prueba de EMSL incluyen los marcadores 2019-nCoV_N1 y N2 del virus. Se trata de una prueba cualitativa de presencia/ausencia.
EMSL cuenta ahora con la acreditación de la AIHA para la identificación rápida del coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19) mediante RT-qPCR en una matriz de hisopado. Número de acreditación de la AIHA: 100194.
Contaminación del aire
Los CDC afirman que la COVID-19 se transmite principalmente de persona a persona a través de gotitas respiratorias. Cuando una persona con COVID-19 tose, estornuda o habla, libera estas gotitas, las cuales pueden ser inhaladas o depositarse en la nariz o la boca de quienes se encuentran cerca. Los CDC también indican que las gotitas respiratorias pueden depositarse en las manos, superficies y objetos que rodean a la persona cuando habla o tose. Los resultados de la prueba de EMSL incluyen los marcadores 2019-nCoV_N1 y N2 del virus. Se trata de una prueba cualitativa de presencia/ausencia.
Contaminación de aguas residuales
Estudios recientes sobre aguas residuales indican que analizar aguas residuales sin tratar para detectar el SARS-CoV-2 es una herramienta epidemiológica importante. EMSL ofrece la prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en muestras de aguas residuales, diseñada para detectar los marcadores 2019-nCoV_N1 y 2019-nCoV_N2 del virus. El protocolo de la prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en aguas residuales ha sido validado por EMSL e incluye procedimientos exhaustivos de control de calidad para garantizar resultados consistentes. Se trata de una prueba cuantitativa.
Pruebas de SARS-CoV-2 en aire, superficies y aguas residuales mediante qPCR
EMSL Analytical, Inc. ahora está aceptando Aire, Torunda, y aguas residuales muestras para confirmar la presencia de SARS-CoV-2 en el ambiente, también conocido como COVID-19. No se aceptan muestras clínicas ni de origen humano.
La prueba RT-qPCR de EMSL es activa contra la variante Delta del coronavirus.
Según los CDC, durante la pandemia de COVID-19 han surgido y circulado variantes genéticas del SARS-CoV-2 en todo el mundo. La variante B.1.617.2 (Delta) del SARS-CoV-2 surgió en la India y actualmente está muy extendida. Se ha elevado el nivel de alerta y seguridad pública, ya que la variante Delta es potencialmente más transmisible que otras variantes del coronavirus.
La prueba RT-qPCR empleada por EMSL para la vigilancia ambiental del SARS-CoV-2 detecta todas las variantes conocidas del virus, incluida la variante Delta. Las mutaciones en la variante Delta afectan a una de las proteínas estructurales del coronavirus, la proteína de la espícula, mientras que la prueba RT-qPCR de EMSL para el SARS-CoV-2 se dirige a una parte diferente del genoma viral: la secuencia de ARN conservada del gen que codifica la proteína de la nucleocápside.
Si bien las campañas de inmunización actuales podrían reducir el riesgo de infecciones individuales, las vías de transmisión de la enfermedad siguen siendo las mismas. Las pruebas para detectar el componente ambiental del contagio por SARS-CoV-2 siguen siendo importantes, ya que las personas inmunizadas pueden portar y propagar patógenos virales sin saberlo.
Análisis
EMSL utiliza una prueba RT-qPCR que detecta el gen N de la nucleocápside del SARS-CoV-2. Este método está especificado por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y autorizado por la Administración de Alimentos y Medicamentos de los Estados Unidos (FDA) para el diagnóstico clínico de la COVID-19. Dado que nuestro análisis no incluye el gen de la ARNasa P humana, la prueba EMSL RT-qPCR solo puede utilizarse para análisis ambientales, no para el procesamiento de muestras de pacientes con SARS-CoV-2. Además, dado que las muestras ambientales suelen contener sustancias inhibidoras de la qPCR presentes en la tierra, el suelo y el polvo, que pueden afectar el rendimiento de la reacción, EMSL aplicará un método patentado de extracción de ácidos nucleicos (AN) a cada muestra. Esto garantizará la eliminación de cualquier inhibidor de la qPCR, así como la detección precisa del ARN viral objetivo.
Haga clic aquí Para obtener más información, consulte el glosario de terminología del laboratorio de ADN de EMSL.
Interpretación de resultados Contaminación
Los resultados de EMSL para el SARS-CoV-2 (COVID-19) se informan como "Detecto" o "No detectado" para dos indicadores del SARS-CoV-2 por muestra, según lo indicado por los CDC. El primer indicador es 2019-nCoV_N1 y el segundo es 2019-nCoV_N2. Ambos indicadores detectan el gen de la proteína de la nucleocápside "N" del coronavirus SARS-CoV-2. El análisis de muestras de aguas residuales es cuantitativo.
Un resultado de "Detectado" para cualquiera de los indicadores puede interpretarse con seguridad como que el área muestreada contenía partículas del coronavirus SARSCoV-2 que podrían considerarse potencialmente infecciosas.
Información sobre la prueba y plazos de entrega
Matriz de aire y muestras de hisopo: presencia/ausencia
Código de prueba EMSL: M330
*Resultados informados al final del día hábil.
Tiempo de respuesta (TAT)
Mismo día
1 día
2 días
3 días
4 días
5 días
Matriz de aguas residuales – Presencia/Ausencia Cuantitativa
Código de prueba EMSL: M330
*Resultados informados al final del día hábil.
Tiempo de respuesta (TAT)
3 días
5 días
10 días
Materiales y medios de muestreo
Muestra de aire:
Cassette PCR / Estéril, 0,4 µm, 37 mm, 3 piezas, filtro de aire de policarbonato para PCR
- $7 cada uno (USD) – Número de artículo 8715309
Cassette de PCR Via-Pore / Estéril, 1,0 µm, 37 mm, 3 piezas, cassette relleno de carbono con almohadilla de soporte
- $12 cada uno (USD) – Número de artículo 8715251
- $110 / Paquete de 10 (USD) – Número de artículo 8715250
Kit de bomba / Kit de bomba de muestreo de aire EMSL PCR: bomba rotativa de paletas de alto volumen, soporte y rotámetro de 3-30 LPM.
- Alquiler: $35 cada uno (USD) por día – Número de artículo 87RD037
- Compra: $325 cada uno (USD) – Número de artículo 8706107
- Adaptadores Luer, paquete de 12 (USD) – Número de artículo 8704300K (requerido)
Muestra de hisopo:
Hisopos estériles para superficies
- $5 cada uno (USD) – Número de artículo 8708935
Muestra de aguas residuales:
Frasco estéril de 120 ml (solo se requieren 100 ml para la toma de muestras).
- $1 cada uno (USD) – Número de artículo 8714235
También se aceptan medios de recolección de muestras alternativos para el análisis de SARS-CoV-2 mediante protocolos establecidos. Dado que podrían requerirse preparaciones adicionales en el laboratorio, comuníquese con EMSL antes de enviar los medios de muestreo alternativos para su análisis.
Instrucciones para el muestreo y el envío
Siga atentamente las instrucciones de muestreo y envío que se indican a continuación.
Cadena de custodia (CCC)
haga clic aquí Para acceder a un PDF editable del protocolo de PCR cuantitativa (qPCR) para SARS-CoV-2 de EMSL, tenga en cuenta que todas las muestras deben enviarse mediante este formulario; de lo contrario, no se procesarán.
Instrucciones para la toma de muestras de aire para el SARS-CoV-2
Instrucciones para el muestreo y el envío
Uso del equipo de protección personal (EPP) adecuado:
- Retire el hisopo del recipiente de transporte desenroscando la tapa. El hisopo quedará adherido a la parte inferior de la tapa.
- Presione ligeramente la punta del hisopo contra el interior del recipiente de transporte para eliminar el exceso de medio de transporte (líquido).
- Utilice el hisopo para tomar muestras de las áreas de interés (generalmente se utilizan 25 cm², pero no es necesario especificar un área). Frote con presión moderada, moviendo el hisopo en al menos dos direcciones diferentes y girándolo para cubrir toda su superficie. Evite que el hisopo se seque por completo.
- Inmediatamente después de tomar la muestra, vuelva a colocar el hisopo en el recipiente de transporte y cierre bien la tapa.
- Limpie el exterior del contenedor de transporte con una toallita con alcohol y etiquete el exterior del contenedor con identificadores de muestra únicos que coincidan con la cadena de custodia (COC) que se va a presentar.
- Recomendamos incluir una muestra de control (muestra en blanco) en cada proyecto. El hisopo de control debe manipularse de la misma manera que las muestras ambientales: en el área de trabajo, abra el paquete y extraiga el hisopo del tubo, pero no lo frote sobre ninguna superficie. Luego, vuelva a colocarlo en el contenedor de transporte.
- Coloca todas las muestras para tu proyecto en una bolsa Ziploc limpia y ciérrala herméticamente.
- Limpie la bolsa Ziploc con una toallita con alcohol, colóquela dentro de otra bolsa Ziploc limpia y ciérrela (las muestras ahora están doblemente embolsadas).
- Realice una última limpieza del exterior de la bolsa Ziploc con una toallita con alcohol.
- Rellene el formulario EMSL SARS-CoV-2 COC y colóquelo dentro de una bolsa Ziploc aparte.
- Empaque bien las muestras para que no se dañen durante el envío. Deben envolverse y enviarse con una bolsa de hielo. El plástico de burbujas se usa comúnmente dentro de una nevera portátil acolchada.
- Escriba en el exterior del contenedor de envío, de forma clara y legible: CÓDIGO DE PRUEBA M330 – SOLO PARA LABORATORIO DE PCR
- Recomendamos enviar las muestras el mismo día de su recolección. Si no es posible enviarlas el mismo día, se pueden refrigerar hasta por 72 horas.
- Las muestras deben enviarse mediante envío prioritario con entrega al día siguiente. EMSL ofrece envío gratuito con FedEx Priority Overnight para clientes existentes a través de LABConnect™.
- Todas las muestras de SARS-CoV-2 deben enviarse a la siguiente dirección. (NOTA: Las muestras SOLO se reciben de lunes a viernes). Se proporcionan etiquetas de FedEx para el envío a través de LABConnect™:
EMSL Analytical, Inc.
**CÓDIGO DE PRUEBA M330 – SOLO PARA LABORATORIO DE PCR**
200 Ruta 130 Norte
Cinnaminson, NJ 08077
- Cualquier muestra que llegue mal embalada, dañada o con fugas será rechazada, no procesada y desechada.
Instrucciones para la toma de muestras de aguas residuales para la detección del SARS-CoV-2
Recomendaciones para la recolección de muestras
- Recoger aguas residuales sin tratar químicamente.
- Consulte los Métodos estándar para el examen de agua y aguas residuales (Sección 9060) para
Sugerencias sobre los procedimientos de muestreo de aguas residuales. - Planifique recolectar muestras que sean representativas del agua que se está analizando.
- Tome precauciones para evitar contaminar las muestras. Use guantes desechables limpios al tomar las muestras.
Tome muestras y evite tocar la boca de la botella con las manos o las superficies. - Las muestras deben enviarse el mismo día en que se recojan.
Instrucciones para la recogida y el envío de muestras
Uso del equipo de protección personal (EPP) adecuado:
- Mantenga el frasco de muestra completamente cerrado hasta justo antes de tomar la muestra. Retire la tapa y no lo apoye sobre ninguna superficie. Tenga cuidado de evitar la contaminación externa durante la toma de la muestra y no contamine la superficie interna de la tapa ni del cuello del frasco.
- Esta prueba requiere 100 ml de aguas residuales crudas sin tratar químicamente por muestra. Al recolectar las muestras, llene el frasco estéril hasta un poco más allá de la línea de 100 ml, hasta el cuello del frasco, dejando un espacio de aire. Vuelva a colocar la tapa inmediatamente y asegúrela.
- Limpie el exterior de la botella con una toallita con alcohol y etiquete el exterior de la botella con identificadores de muestra únicos que coincidan con la cadena de custodia (COC) que se va a presentar.
- Vuelva a colocar la botella dentro de la bolsa de burbujas en la que llegó la muestra del laboratorio y ciérrela herméticamente. Como alternativa, puede colocar la botella en dos bolsas selladas con cierre hermético.
- Limpie la bolsa envuelta en plástico de burbujas con una toallita con alcohol.
- Rellene el formulario de cadena de custodia EMSL SARS-CoV-2, colóquelo en una bolsa con cierre hermético aparte y ciérrela.
- Empaque bien las muestras para que no se dañen durante el envío. Las muestras deben ir envueltas y enviadas con una bolsa de hielo. El plástico de burbujas se usa comúnmente dentro de una nevera portátil acolchada. Envíe las muestras utilizando el contenedor de envío isotérmico proporcionado.
- Escriba en el exterior del contenedor de envío de forma clara y legible:
CÓDIGO DE PRUEBA M330 – SOLO PARA LABORATORIO DE PCR - Las muestras deben enviarse el mismo día de su recolección. Si no es posible enviarlas el mismo día, manténgalas refrigeradas pero sin congelar (<8 °C) durante el transporte al laboratorio para su procesamiento. Las muestras de aguas residuales pueden almacenarse a 2–8 °C hasta 72 horas después de su recolección.
- Las muestras deben enviarse mediante envío prioritario con entrega al día siguiente. EMSL ofrece envío gratuito con FedEx Priority Overnight para clientes existentes a través de LABConnect™.
- Todas las muestras de SARS-CoV-2 deben enviarse a la siguiente dirección. (NOTA: Solo se recibirán muestras de lunes a viernes).
EMSL Analytical, Inc.
**CÓDIGO DE PRUEBA M330 – SOLO PARA LABORATORIO DE PCR**
200 Ruta 130 Norte
Cinnaminson, NJ 08077
- Cualquier muestra que llegue mal embalada, dañada o con fugas será rechazada, no procesada y desechada.
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