Teste para SARS-CoV-2 (COVID-19)
Contexto e transmissão
De acordo com os Centros de Controle e Prevenção de Doenças (CDC) dos EUA, a COVID-19 é uma doença respiratória que pode se espalhar de pessoa para pessoa. A principal via de infecção é entre pessoas que estão em contato próximo (a cerca de 2 metros de distância) por meio de gotículas respiratórias produzidas quando uma pessoa infectada tosse ou espirra. Também é possível que uma pessoa contraia a COVID-19 ao tocar uma superfície ou objeto contaminado com o vírus e, em seguida, tocar a boca, o nariz ou os olhos. Atualmente, acredita-se que a transmissão por superfícies não seja a principal forma de propagação do vírus; no entanto, a atualização do CDC de 13 de abril observou: “A COVID-19 é uma doença nova e ainda estamos aprendendo sobre como ela se espalha e a gravidade dos sintomas que causa.”
Contaminação de superfície
Estudos recentes sugerem que o vírus SARS-CoV-2 pode permanecer viável e infeccioso em superfícies por horas ou dias, dependendo do tipo de material da superfície (tecido, azulejo, aço, etc.). A limpeza e desinfecção completas de superfícies tocadas com frequência são recomendadas pelo CDC e consideradas essenciais para prevenir a disseminação da infecção¹. A presença ou ausência do material genético viral em superfícies ambientais agora pode ser testada diretamente com o novo teste molecular para SARS-CoV-2 da EMSL e usada para demonstrar a eficácia dos protocolos de limpeza. Os resultados do teste da EMSL incluem os marcadores 2019-nCoV_N1 e N2 do vírus. Este é um teste qualitativo de presença/ausência.
O EMSL agora possui acreditação da AIHA para a identificação rápida do coronavírus SARS-CoV-2 (COVID-19) por RT-qPCR em matriz de swab. Número de acreditação da AIHA: 100194.
Contaminação do ar
O CDC afirma que a COVID-19 é transmitida principalmente de pessoa para pessoa por meio de gotículas respiratórias. Quando alguém com COVID-19 tosse, espirra ou fala, essas gotículas são liberadas e podem ser inaladas ou atingir o nariz ou a boca de pessoas próximas. O CDC também afirma que as gotículas respiratórias podem se depositar nas mãos, superfícies e objetos ao redor da pessoa quando ela fala ou tosse. Os resultados dos testes do EMSL incluem os marcadores N1 e N2 do vírus 2019-nCoV. Este é um teste qualitativo de presença/ausência.
Contaminação de águas residuais
Estudos recentes sobre águas residuais indicam que a análise de águas residuais não tratadas para detecção do SARS-CoV-2 é uma importante ferramenta epidemiológica. O EMSL oferece o teste RT-PCR para SARS-CoV-2 em amostras de águas residuais, projetado para detectar os marcadores 2019-nCoV_N1 e 2019-nCoV_N2 do vírus. O protocolo do teste RT-PCR para SARS-CoV-2 em águas residuais foi validado pelo EMSL e conta com procedimentos abrangentes de controle de qualidade para garantir resultados consistentes. Este é um teste quantitativo.
Testes de SARS-CoV-2 no ar, em superfícies e em águas residuais por qPCR
A EMSL Analytical, Inc. agora está aceitando inscrições. Ar, Cotonete, e águas residuais Amostras para confirmar a presença do SARS-CoV-2 no ambiente, também conhecido como COVID-19. Amostras clínicas ou derivadas de seres humanos não são aceitas.
O teste RT-qPCR do EMSL é eficaz contra a variante Delta do coronavírus.
De acordo com o CDC, variantes genéticas do SARS-CoV-2 têm surgido e circulado pelo mundo durante a pandemia de COVID-19. A variante SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) surgiu na Índia e está atualmente disseminada. O nível de segurança e conscientização pública aumentou, visto que a variante Delta é potencialmente mais transmissível do que outras variantes do coronavírus.
O teste RT-qPCR utilizado pelo EMSL para a vigilância ambiental do SARS-CoV-2 detecta todas as variantes conhecidas do SARS-CoV-2, incluindo a variante Delta. As mutações na variante Delta afetam uma das proteínas estruturais do coronavírus, chamada proteína spike, enquanto o teste RT-qPCR do EMSL para SARS-CoV-2 tem como alvo uma parte diferente do genoma viral: a sequência de RNA conservada do gene que codifica a proteína do nucleocapsídeo.
Embora os esforços atuais de imunização possam reduzir o risco de infecções individuais, as vias de transmissão da doença permanecem as mesmas. Testar o componente ambiental da contaminação por SARS-CoV-2 continua sendo importante, visto que indivíduos imunizados podem, sem saber, ser portadores e disseminadores de patógenos virais.
Análise
O EMSL utiliza um teste RT-qPCR que tem como alvo o gene da proteína N do nucleocapsídeo do SARS-CoV-2. Este método é especificado pelos Centros de Controle e Prevenção de Doenças (CDC) e autorizado pela Administração de Alimentos e Medicamentos dos EUA (FDA) para o diagnóstico clínico da COVID-19. Como o gene da RNAse P humana não é analisado em nosso teste, o teste EMSL RT-qPCR só pode ser usado para testes ambientais, e não para processar amostras de pacientes com SARS-CoV-2. Além disso, como as amostras ambientais frequentemente contêm substâncias inibidoras de qPCR presentes em sujeira, solo e poeira, que podem afetar o desempenho da reação de qPCR, o EMSL aplicará um método proprietário de extração de ácido nucleico (AN) a cada amostra. Isso garantirá a remoção de quaisquer inibidores de qPCR, bem como a detecção precisa do RNA viral alvo.
Clique aqui Para saber mais, consulte o Glossário de Terminologia do Laboratório de DNA do EMSL.
Contaminação na interpretação dos resultados
Os resultados do EMSL para SARS-CoV-2 (COVID-19) são relatados como "Detectado" ou "Não Detectado" para dois indicadores do SARS-CoV-2, por amostra, conforme orientação do CDC. O primeiro indicador é o 2019-nCoV_N1 e o segundo é o 2019-nCoV_N2. Ambos os indicadores detectam o gene da proteína do nucleocapsídeo 'N' do coronavírus SARS-CoV-2. A análise das amostras de águas residuais é quantitativa.
Um resultado de "Detectado" para qualquer um dos indicadores pode ser interpretado com segurança como sendo de que a área amostrada continha partículas do coronavírus SARS-CoV-2 que poderiam ser consideradas potencialmente infecciosas.
Informações sobre o teste e prazo de entrega
Matriz de ar e cotonete – Presença/Ausência
Código de teste EMSL: M330
*Resultados divulgados no final do dia útil.
Tempo de resposta (TAT)
No mesmo dia
1 dia
2 dias
3 dias
4 dias
5 dias
Matriz de águas residuais – Presença/Ausência Quantitativa
Código de teste EMSL: M330
*Resultados divulgados no final do dia útil.
Tempo de resposta (TAT)
3 dias
5 dias
10 dias
Materiais e meios de amostragem
Amostra de ar:
Cassete PCR / Estéril, 0,4 µm, 37 mm, 3 peças, Filtro de ar PCR em policarbonato
- $7 cada (USD) – Item número 8715309
Cassete de PCR Via-Pore / Estéril, 1,0 µm, 37 mm, 3 peças, cassete preenchida com carbono com almofada de suporte
- $12 cada (USD) – Item número 8715251
- $110 / Pacote com 10 (USD) – Item número 8715250
Kit de Bomba / Kit de Bomba para Amostragem de Ar por PCR EMSL – Bomba Rotativa de Palhetas de Alto Volume, Suporte e Rotâmetro de 3-30 LPM
- Aluguel: $35 cada (USD) por dia – Item número 87RD037
- Compra: $325 cada (USD) – Item número 8706107
- Pacote com 12 adaptadores Luer (USD) – Item número 8704300K (obrigatório)
Coletar amostra com cotonete:
Cotonetes estéreis para superfícies
- $5 cada (USD) – Item número 8708935
Amostra de águas residuais:
Frasco estéril de 120 ml (apenas 100 ml são necessários para a coleta de amostras)
- $1 cada (USD) – Item número 8714235
Meios alternativos de coleta de amostras também podem ser aceitos para análise de SARS-CoV-2, utilizando protocolos estabelecidos. Como preparações laboratoriais adicionais podem ser necessárias, entre em contato com o EMSL antes de enviar meios de coleta alternativos para análise.
Instruções para Amostragem e Envio
Siga atentamente as instruções de amostragem e envio abaixo.
Cadeia de Custódia (COC)
Clique aqui Para acessar um PDF editável do Certificado de Cuidados (COC) de qPCR para SARS-CoV-2 do EMSL, clique aqui. Todas as amostras devem ser enviadas por meio deste formulário, caso contrário, não serão processadas.
Instruções para coleta de amostras de ar para SARS-CoV-2
Instruções para Amostragem e Envio
Utilizar equipamento de proteção individual (EPI) adequado:
- Retire o cotonete do recipiente de transporte desenroscando a tampa. O cotonete estará preso na parte inferior da tampa.
- Pressione levemente a ponta do cotonete na parte interna do recipiente de transporte para remover o excesso de meio de transporte (líquido).
- Utilize um cotonete para coletar amostras das áreas de interesse (25 cm² é uma área comum, mas não é necessário especificar uma área). Aplique pressão moderada, movendo o cotonete em pelo menos duas direções diferentes e girando-o para que toda a sua superfície seja utilizada. Evite deixar o cotonete secar completamente.
- Imediatamente após a coleta da amostra, coloque o cotonete de volta no recipiente de transporte e feche bem a tampa.
- Limpe a parte externa do recipiente de transporte com um lenço umedecido em álcool e etiquete-o com identificadores de amostra exclusivos que correspondam à Cadeia de Custódia (COC) a ser submetida.
- Recomendamos que uma amostra de controle (branco de campo) seja incluída em todos os projetos. O swab de controle deve ser manuseado da mesma forma que as amostras ambientais: na área de trabalho, abra a embalagem e retire o swab do tubo, mas não o utilize para coletar amostras de nenhuma superfície. Em seguida, coloque-o de volta no recipiente de transporte.
- Coloque todas as amostras para o seu projeto em um saco plástico limpo com fecho hermético.
- Limpe o saco Ziploc com um lenço umedecido com álcool, coloque-o dentro de outro saco Ziploc limpo e feche-o (as amostras agora estão embaladas em dois sacos).
- Limpe a parte externa do saco Ziploc com um lenço umedecido em álcool.
- Preencha o formulário EMSL SARS-CoV-2 COC e coloque-o dentro de um saco Ziploc separado.
- Embale bem as amostras para que não sejam danificadas durante o transporte. As amostras devem ser embaladas e enviadas com gelo seco. É comum utilizar plástico bolha dentro de uma caixa térmica acolchoada.
- Escreva na parte externa da embalagem de forma clara e legível: CÓDIGO DO TESTE M330 – SOMENTE PARA LABORATÓRIO DE PCR
- Recomendamos o envio das amostras no mesmo dia da coleta. Caso não seja possível o envio no mesmo dia da coleta, as amostras podem ser refrigeradas por até 72 horas.
- As amostras devem ser enviadas por entrega expressa prioritária. A EMSL oferece frete grátis FedEx Priority Overnight para clientes já cadastrados através do LABConnect™.
- Todas as amostras de SARS-CoV-2 devem ser enviadas para o seguinte endereço. (OBSERVAÇÃO: as amostras podem ser recebidas SOMENTE de segunda a sexta-feira). Etiquetas da FedEx são fornecidas para envio via LABConnect™:
EMSL Analytical, Inc.
**CÓDIGO DO TESTE M330 – SOMENTE PARA LABORATÓRIO DE PCR**
200 Rota 130 Norte
Cinnaminson, NJ 08077
- Quaisquer amostras que chegarem em embalagem inadequada, danificadas ou com vazamento serão rejeitadas, não processadas e descartadas.
Instruções para coleta de amostras de águas residuais para detecção do SARS-CoV-2
Recomendações para coleta de amostras
- Recolha as águas residuais brutas que não tenham sido tratadas quimicamente.
- Consulte os Métodos Padrão para o Exame de Água e Esgoto (Seção 9060) para obter mais informações.
Sugestões sobre procedimentos de amostragem de águas residuais. - Planeje coletar amostras que sejam representativas da água que está sendo testada.
- Tome precauções para evitar a contaminação das amostras. Use luvas descartáveis limpas ao coletá-las.
Amostras e evite tocar na boca do frasco com as mãos ou superfícies. - As amostras devem ser enviadas no mesmo dia em que forem coletadas.
Instruções para coleta e envio de amostras
Utilizar equipamento de proteção individual (EPI) adequado:
- Mantenha o frasco de amostra completamente fechado até o momento da coleta. Remova a tampa e não coloque o frasco sobre nenhuma superfície. Tome cuidado para evitar contaminação externa durante a coleta da amostra e não contamine a superfície interna da tampa e do gargalo do frasco.
- Este teste requer 100 ml de esgoto bruto, sem tratamento químico, por amostra. Ao coletar as amostras, encha o frasco estéril até um pouco além da linha de 100 ml, até o gargalo, deixando um pequeno espaço de ar no frasco. Recoloque a tampa imediatamente e feche-a bem.
- Limpe a parte externa do frasco com um lenço umedecido em álcool e etiquete-o com identificadores de amostra exclusivos que correspondam à Cadeia de Custódia (COC) a ser submetida.
- Coloque o frasco de volta dentro do saco plástico com bolhas em que a amostra chegou do laboratório e feche bem. Como alternativa, coloque o frasco em dois sacos plásticos com fecho hermético.
- Limpe o saco envolto em plástico bolha com um lenço umedecido com álcool.
- Preencha o formulário de Cadeia de Custódia do SARS-CoV-2 da EMSL, coloque-o em um saco plástico com fecho hermético e feche-o bem.
- Embale bem as amostras para que não sejam danificadas durante o transporte. As amostras devem ser embaladas e enviadas com gelo seco. O plástico bolha é comumente utilizado dentro de uma caixa térmica acolchoada. Envie as amostras utilizando a caixa de transporte isolada fornecida.
- Escreva na parte externa da embalagem de forma clara e legível:
CÓDIGO DO TESTE M330 – SOMENTE PARA LABORATÓRIO DE PCR - As amostras devem ser enviadas no mesmo dia da coleta. Caso não seja possível o envio no mesmo dia da coleta, mantenha as amostras refrigeradas, mas não congeladas (abaixo de 8 °C), durante o transporte até o laboratório para processamento. As amostras de águas residuais podem ser armazenadas entre 2 e 8 °C por até 72 horas após a coleta.
- As amostras devem ser enviadas por entrega expressa prioritária. A EMSL oferece frete grátis FedEx Priority Overnight para clientes já cadastrados através do LABConnect™.
- Todas as amostras de SARS-CoV-2 devem ser enviadas para o seguinte endereço. (OBSERVAÇÃO: as amostras podem ser recebidas SOMENTE de segunda a sexta-feira).
EMSL Analytical, Inc.
**CÓDIGO DO TESTE M330 – SOMENTE PARA LABORATÓRIO DE PCR**
200 Rota 130 Norte
Cinnaminson, NJ 08077
- Quaisquer amostras que chegarem em embalagem inadequada, danificadas ou com vazamento serão rejeitadas, não processadas e descartadas.
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